Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf144aQ925F3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf144aQ925F3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf144aQ925F3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf144aQ925F3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf144aQ925F3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rnf144aQ925F3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf144aQ925F3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rnf144aQ925F3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Rnf144aQ925F3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf144aQ925F3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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