Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim59Q922Y2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms