Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Ttc8Q8VD72 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Ttc8Q8VD72 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ttc8Q8VD72 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ttc8Q8VD72 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ttc8Q8VD72 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ttc8Q8VD72 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms