Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sde2Q8K1J5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms