Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Afg3l2Q8JZQ2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Afg3l2Q8JZQ2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Afg3l2Q8JZQ2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l2Q8JZQ2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l2Q8JZQ2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l2Q8JZQ2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l2Q8JZQ2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l2Q8JZQ2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms