Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Brf1Q8CFK2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Brf1Q8CFK2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Brf1Q8CFK2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Brf1Q8CFK2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Brf1Q8CFK2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Brf1Q8CFK2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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