Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hpf1Q8CFE2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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