Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SynpoQ8CC35 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms