Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4aQ8BW72 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119 ms