Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
H2-M10.4Q85ZW8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms