Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SnupnQ80W37 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms