Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Rims3Q80U57 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rims3Q80U57 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms