Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

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Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pram1Q6BCL1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pram1Q6BCL1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pram1Q6BCL1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms