Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrcc1Q69ZB0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms