Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp4Q68FH0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp4Q68FH0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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