Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PatjQ63ZW7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms