Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Foxd1Q61345 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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