Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Klf3Q60980 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms