Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms