Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Traf3Q60803 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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