Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc27a1Q60714 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc27a1Q60714 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms