Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm1Q60636 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm1Q60636 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms