Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Trappc1Q5NCF2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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