Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbof1Q3V079 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms