Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Znf48Q3US17 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Znf48Q3US17 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Znf48Q3US17 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Znf48Q3US17 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Znf48Q3US17 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Znf48Q3US17 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Znf48Q3US17 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Znf48Q3US17 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Znf48Q3US17 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Znf48Q3US17 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Znf48Q3US17 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Znf48Q3US17 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Znf48Q3US17 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Znf48Q3US17 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms