Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cog7Q3UM29 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms