Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem35bQ3U0Y2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms