Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trmt1Q3TX08 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trmt1Q3TX08 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trmt1Q3TX08 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt1Q3TX08 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt1Q3TX08 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt1Q3TX08 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trmt1Q3TX08 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trmt1Q3TX08 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trmt1Q3TX08 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trmt1Q3TX08 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trmt1Q3TX08 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Trmt1Q3TX08 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt1Q3TX08 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt1Q3TX08 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Trmt1Q3TX08 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trmt1Q3TX08 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Trmt1Q3TX08 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trmt1Q3TX08 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Trmt1Q3TX08 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms