Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ccbe1Q3MI99 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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