Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trim71Q1PSW8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim71Q1PSW8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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