Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Fam171bQ14CH0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Fam171bQ14CH0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms