Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn2bQ0KL01 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubxn2bQ0KL01 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms