Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cnnm1Q0GA42 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cnnm1Q0GA42 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms