Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tgm3Q08189 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tgm3Q08189 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms