Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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F13bQ07968 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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F13bQ07968 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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F13bQ07968 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
F13bQ07968 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F13bQ07968 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
F13bQ07968 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms