Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cdx4Q07424 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms