Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PtprgQ05909 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprgQ05909 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms