Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RykQ01887 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RykQ01887 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RykQ01887 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms