Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HmgcrQ01237 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms