Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rbp4Q00724 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbp4Q00724 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms