Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig3P97386 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig3P97386 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lig3P97386 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms