Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Snap25P60879 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap25P60879 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snap25P60879 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms