Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csrnp1P59054 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms