Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Bace1P56818 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Bace1P56818 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms