Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Irf5P56477 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms