Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gp1bbP56400 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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