Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
BckdhaP50136 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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