Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb42P49222 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Epb42P49222 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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