Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca1P48754 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brca1P48754 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca1P48754 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brca1P48754 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms