Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tnfsf9P41274 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms